[log in to unmask] schrieb:
>> Dear listers,
>>
>> I have to buy a new computer for our team that will be used as for offline
>> image analysis. The software required (ImageJ, Metamorph, Matlab) require
>> to
>> build a Windows/Vista machine. The cost would be around $5,000 / 5000€.
>> The
>> job would be processing (a lot) and rendering. My questions are :
>> - Should I go for a "traditionnal" computer, I mean a 32-bits, dual core,
>> XP
>> computer with maxed RAM (I guess it is 3GB or so) ? Is it usefull to go to
>> more fancy stuff like 64 bits, 4 or 8 core, 8 to 16GB RAM machine ? Would
>> ImageJ/Metamorph/Matlab really benefit from it (I would love to have an
>> answer from the Metamorph/Matlab people) ?
>> - What about graphic cards and GPU ? What is the best choice ? I've heard
>> about new strategies to speed up processing by making the GPU churn data
>> as
>> well as graphics, but I don't think it is really commercially available
>> now
>> or implemented in commercial software yet.
>>
>>
>
> Salut Christophe, je te fais une reponse off-liste histoire de causer
> frenchie. Le software que je connais le mieux est Matlab, voila ce que je
> peux t'en dire.
>
>
> Sous windows, le support par Matlab des architectures 64 bits est pour
> tres bientot (soit la fin de l'annee soit debut 2009 au pire). Il y a
> beaucoup de benefices a y trouver:
> - Matlab bosse presque uniquement avec des nombres 'double' qui prennent
> 64 bits. Avec une architecture 64 bit, chaque operation sur eux prend un
> tic et non pas deux comme maintenant.
> - Matlab est tres gourmand en memoire (il la gere assez mal), avec un
> system 64 bit tu peux te payer 16Go de RAM.
> - Certaines operations de Matlab prennent avantages du multi coeur
> nativement (multiplication de matrices etc...), mais autrement et pour la
> grande majorite de ce qui va t'interesser, un simple coeur suffit. Aller
> au dela de 4 coeurs est inutile dans ton cas je pense.
> - Il existe des version d'ImageJ qui travaille en 64bit. Dans mon groupe
> un type bosse dessus (va voir sur la page notre projet
> http://pacific.mpi-cbg.de/wiki/index.php/Main_Page, c'est encore le
> bordel, ne t'attend a rien de magique). C'est tres utile, parce que la
> aussi on a vite fait de bouffer toute la memoire.
>
>
> Je sais que Imaris et Volocity utilisent les GPU a fond, et en dependent
> meme pour la visualisation 3D/4D (acceleration materielle et tout et
> tout). Pour Matlab et Metamorph (ce dernier etant quand meme bien en
> retard..) j'en doute.
>
> J'espere que c'est utile
> A bientot
> jy
>
>
>
>
> --
> Jean-Yves Tinevez, PhD
> Image Processing Facility head
> Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics
> Pfotenhauerstr. 108, 01307 Dresden
> Germany
> tel +49 (0)351 210 2889
> fax +49 (0)351 210 1489
> e-mail: [log in to unmask]
>
...pas si "horts liste", ta réponse ;-)
JC
--
Jean-Christophe Olaya
Biotechnologisches Zentrum der TU Dresden
Light Microscopy Facility
Tatzberg 47-51
01307 Dresden
Germany
email: [log in to unmask]
Tel: +49 351 463-40230
Fax: +49 351 463-40038
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